Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ccdc180J3QNE4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms