Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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