Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pcf11G3X9Z4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms