Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sh3tc1G3X9F6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms