Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms