Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ScaperF8VQ70 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms