Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms