Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
D430041D05RikF6ZGR6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms