Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Erich3F6QRE9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Erich3F6QRE9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Erich3F6QRE9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Erich3F6QRE9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Erich3F6QRE9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Erich3F6QRE9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Erich3F6QRE9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Erich3F6QRE9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Erich3F6QRE9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Erich3F6QRE9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Erich3F6QRE9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Erich3F6QRE9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Erich3F6QRE9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Erich3F6QRE9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Erich3F6QRE9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms