Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms