Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms