Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DspE9Q557 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DspE9Q557 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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DspE9Q557 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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DspE9Q557 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DspE9Q557 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms