Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms