Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
4930426L09RikE9Q0N7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4930426L09RikE9Q0N7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms