Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim30dE9PWL0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30dE9PWL0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30dE9PWL0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30dE9PWL0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms