Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms