Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Syde2E9PUP1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms