Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC035044E0CXF8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC035044E0CXF8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC035044E0CXF8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC035044E0CXF8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC035044E0CXF8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC035044E0CXF8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC035044E0CXF8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC035044E0CXF8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC035044E0CXF8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC035044E0CXF8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC035044E0CXF8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms