Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930467E23RikD3Z1P8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930467E23RikD3Z1P8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms