Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200bD3Z0P8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms