Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms