Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmf1B9EKI3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
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