Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cttnbp2B9EJA2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms