Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia1B2RXQ2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia1B2RXQ2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia1B2RXQ2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia1B2RXQ2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia1B2RXQ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia1B2RXQ2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia1B2RXQ2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfia1B2RXQ2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfia1B2RXQ2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia1B2RXQ2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppfia1B2RXQ2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppfia1B2RXQ2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia1B2RXQ2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia1B2RXQ2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia1B2RXQ2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia1B2RXQ2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia1B2RXQ2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia1B2RXQ2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia1B2RXQ2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms