Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clrn2B2RVW2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms