Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ythdc2B2RR83 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms