Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms