Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms