Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms