Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samt1A2BED8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms