Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl41A2AUC9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms