Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FocadA2AKG8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms