Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms