Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62clA2AG10 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62clA2AG10 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms