Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp8nlA2ABX0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms