Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prdm16A2A935 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms