Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms