Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prdm2A2A7B5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm2A2A7B5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms