Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms