Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv21A0A0A6YX06 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms