Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Dxo-208ENSMUST00000174092 738 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm10472-201ENSMUST00000193014 2102 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 AC126805.1-201ENSMUST00000225142 262 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hdac5Q9Z2V6 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm7389-201ENSMUST00000181162 2884 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 C9-201ENSMUST00000022749 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Slc12a8-201ENSMUST00000059056 3166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Olfr978-202ENSMUST00000217600 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Zfp93-202ENSMUST00000108438 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Npnt-201ENSMUST00000042729 3601 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Fer-201ENSMUST00000000129 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm36879-201ENSMUST00000212313 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc28-204ENSMUST00000169982 3535 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Klrb1b-201ENSMUST00000032472 2228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Zfp677-202ENSMUST00000162659 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Hdac5Q9Z2V6 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Hdac5Q9Z2V6 Gm34304-201ENSMUST00000218927 1139 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Hdac5Q9Z2V6 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Hdac5Q9Z2V6 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Smpd4-209ENSMUST00000165363 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Sox6-203ENSMUST00000166207 2825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Ghitm-202ENSMUST00000165649 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Tyrp1-202ENSMUST00000102831 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm2233-201ENSMUST00000222566 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Fam90a1a-201ENSMUST00000110741 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 AC154634.1-201ENSMUST00000225225 2394 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 C5ar2-202ENSMUST00000171425 3381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Tvp23a-201ENSMUST00000051118 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 AC122397.1-201ENSMUST00000228650 2819 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 4930524O08Rik-202ENSMUST00000184444 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms