Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm27166-201ENSMUST00000184476 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm17359-203ENSMUST00000199658 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 4933402N03Rik-201ENSMUST00000070980 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm43218-201ENSMUST00000196275 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Slc44a1-202ENSMUST00000107645 2365 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm17821-201ENSMUST00000223448 1693 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Zfp958-201ENSMUST00000073201 1401 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm12178-201ENSMUST00000120545 330 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm4302-201ENSMUST00000168769 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm45549-201ENSMUST00000210180 975 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gpx4-ps2-202ENSMUST00000217344 782 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms