Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Scn2a-205ENSMUST00000200829 6348 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm44437-201ENSMUST00000203832 4038 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms