Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Inpp5d-210ENSMUST00000169754 4937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Me1-202ENSMUST00000185374 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm26748-201ENSMUST00000180406 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms