Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms