Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms