Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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