Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Olfr1219-205ENSMUST00000217421 5849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4dQ8BGV9 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms