Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms