Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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